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鼎湖山植物DNA條形碼研究獲進(jìn)展
發(fā)布時間:
2014-12-05 20:50
來源:
《中國科學(xué)報》 (2014-12-03 第4版 綜合)
【博雅景觀:dgyongle.com】
【導(dǎo)語】DNA條形碼技術(shù)是一種利用標(biāo)準(zhǔn)的簡短基因片段來實現(xiàn)物種快速識別的工具。動物界,線粒體COI基因應(yīng)用非常成功。但是在植物界,由于進(jìn)化歷史復(fù)雜,標(biāo)準(zhǔn)條形碼還沒有達(dá)成共識。日前,中科院華南植物園研究人員在鼎湖山木本植物DNA條形碼研究方面取得重要進(jìn)展。相關(guān)結(jié)果在線發(fā)表于《多樣性及其分布》上。
DNA條形碼技術(shù)是一種利用標(biāo)準(zhǔn)的簡短基因片段來實現(xiàn)物種快速識別的工具。動物界,線粒體COI基因應(yīng)用非常成功。但是在植物界,由于進(jìn)化歷史復(fù)雜,標(biāo)準(zhǔn)條形碼還沒有達(dá)成共識。
針對此種情況,華南植物園分子生態(tài)學(xué)研究團(tuán)隊研究員葛學(xué)軍及博士研究生劉娟攜手加拿大圭爾夫大學(xué)Steven G. Newmaster博士,通過構(gòu)建鼎湖山531種木本植物條形碼數(shù)據(jù)庫,分析了五個常用的條形碼片段及其片段組合的物種識別能力。結(jié)果顯示,三個片段組合的物種分辨率最高,達(dá)94.19%。該項研究通過NMDS分析,揭示了核基因和葉綠體基因在物種識別能力上存在不一致性?;趯嶒灣杀尽⑵螖U(kuò)增成功率及物種分辨綜合權(quán)衡考慮,推薦一種片段組合作為亞熱帶森林植物的DNA條形碼片段。
研究人員強(qiáng)調(diào)條形碼能將90%以上的樣品鑒定到正確的屬內(nèi),這對熱帶或亞熱帶生物多樣性調(diào)查具有重要意義。該研究還預(yù)計,在亞洲熱帶森林中低緯度地區(qū)域,由于大量存在的大屬,DNA條形碼的物種識別能力可能較低。
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